Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scp2P32020 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms