Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18528 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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P18528 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18528 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms