Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms