Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TsksO54887 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TsksO54887 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TsksO54887 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TsksO54887 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TsksO54887 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms