Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Opn1mwO35599 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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