Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms