Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms