Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp42B2RQC2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms