Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF4

Grina, Protein lifeguard 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrinaQ9ESF4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GrinaQ9ESF4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GrinaQ9ESF4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms