Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms