Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms