Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ciao1Q99KN2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ciao1Q99KN2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ciao1Q99KN2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ciao1Q99KN2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ciao1Q99KN2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms