Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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