Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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