Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phc3Q8CHP6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phc3Q8CHP6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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