Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms