Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gpc3Q8CFZ4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms