Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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