Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms