Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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