Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms