Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms