Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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