Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma5Q5DTT8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma5Q5DTT8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms