Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms