Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms