Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sox10Q04888 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sox10Q04888 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sox10Q04888 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sox10Q04888 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sox10Q04888 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms