Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serpina1cQ00896 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms