Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Otx1P80205 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms