Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms