Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr5P51682 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms