Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cap1P40124 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms