Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms