Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18525 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18525 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18525 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18525 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18525 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18525 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18525 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18525 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18525 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18525 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18525 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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