Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna3O08545 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna3O08545 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna3O08545 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna3O08545 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna3O08545 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms