Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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