Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa28D3Z1V9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms