Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syce3B5KM66 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms