Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms