Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapaQ9WV55 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VapaQ9WV55 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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VapaQ9WV55 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VapaQ9WV55 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VapaQ9WV55 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VapaQ9WV55 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapaQ9WV55 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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