Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms