Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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