Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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