Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn9Q9D805 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms