Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms