Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23bQ9D662 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23bQ9D662 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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