Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1lQ9CXF7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms