Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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