Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms