Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab3il1Q8VDV3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3il1Q8VDV3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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